La présence de l’eau génère souvent une forte diversification de milieux qui crée des habitats favorables à de nombreux mammifères.
On peut citer deux espèces autochtones : la loutre et le castor, qui étaient proches de la disparition sur le territoire métropolitain du fait des persécutions qu’ils subissaient. Le Puy de Dôme représentait d’ailleurs l’un des derniers bastions de la loutre ; si bien qu’elle devint la mascotte du département.
Aujourd’hui, les mesures de protection mises en place portent leur fruit et ces deux mammifères ont déjà plus ou moins bien recolonisé les lacs et rivières qu’ils occupaient autrefois.
D’autres espèces introduites par l’homme comme le ragondin ou le rat musqué sont inféodés aux milieux aquatiques ; ils provoquent parfois des déséquilibres, aussi leurs populations doivent être régulées.
Evidemment, tous les mammifères doivent boire, ils fréquentent donc tous occasionnellement les milieux humides.